El área de formación académica de la Escuela de Trabajo san José, busca el restablecimiento del derecho a la educación permitiendo el acceso a ella, además de fomentar procesos de aprendizajes incluyentes con altos índices de calidad. La institución realiza adaptaciones curriculares para que los niños, niñas, adolescentes y jóvenes logren finalizar sus estudios secundarios, sensibilizando sobre la importancia de la educación para abrir posibilidades a futuro a nivel académico (técnicas, tecnologías y carreras profesionales) y  laboral; para ello, la institución se inscribe en la pedagogía activa desde un enfoque constructivista, donde la meta educativa es que cada estudiante acceda progresiva y secuencialmente, a la etapa superior de desarrollo intelectual, de acuerdo con las necesidades y condiciones de cada uno, donde el maestro crea un ambiente favorecedor de experiencias que facilitan el aprendizaje. A través del plan de estudio busca posibilitar entre sus estudiantes, una oportunidad de formación que dé respuesta a las necesidades y expectativas académicas. Entiéndase la educación como un proceso de apropiación y desarrollo permanente de saberes, habilidades, actitudes y valores en todas las dimensiones de la vida humana.  En éste sentido, deben considerarse contenidos tales como: desarrollo humano, medio ambiente, democracia, participación, integración, entre otros, e incorporar la preocupación preferente por actores sociales como: las mujeres, los jóvenes, la población LGTBI, los grupos étnicos y los trabajadores de la economía informal.

En síntesis, el  plan de estudio institucional, es concebido en su consolidado  como una oportunidad de preparación y motivación hacia el aprendizaje con contenidos sincronizados entre las orientaciones educativas dadas a través del Ministerio de Educación Nacional – MEN – y  las características de los estudiantes;  para su avance  se ha definido una metodología y didáctica que favorezca el acto educativo, el desarrollo de competencias, promueva el ejercicio de actitudes, valores humanos y formas elementales de trabajo a través de las diferentes áreas del conocimiento.